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我院牵头开发的哺乳动物下丘脑单细胞测序数据分析平台上线

信息来源:徐峰 发布时间:2025-01-20 浏览次数:
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  近期,由山东第一医科大学附属省立医院(精品人妻一区二区三区浪潮在线)“内分泌糖脂代谢与脑老化”教育部重点实验室赵家军教授与徐峰教授牵头,复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室刘铁民教授、张智教授,华大生命科学研究院刘石平博士,深圳国家基因库杨涛博士等联合开发的哺乳动物下丘脑单细胞测序数据分析平台“Hypothalamus Cell Atlas (HCA)”平台上线。

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  下丘脑作为调控机体内稳态的重要神经中枢,参与多种激素的合成与释放,承担调控基本生命功能的核心任务,包括饮水与摄食行为、能量代谢、液体和电解质平衡、体温调节、觉醒-睡眠周期的维持、对压力源的应激反应以及与交配、分娩和哺乳相关的生殖行为等且相关机制不明。近年来,单细胞测序技术的应用显着推动了下丘脑研究的进展,为解析其在糖脂代谢和脑老化中的功能机制提供了全新视角。然而,现有公开的单细胞测序数据尚未系统整合,这不仅增加了数据获取与分析的复杂性,同时由于分析过程对硬件和技术要求较高,也限制了相关研究的广泛开展。

  贬颁础平台专注于哺乳动物下丘脑单细胞转录组数据的整合,汇集了人类、小鼠、狨猴和猕猴等多物种的下丘脑单细胞转录组测序数据。访问地址为:丑迟迟辫蝉://诲产.肠苍驳产.辞谤驳/肠诲肠辫/丑肠补/。目前尚未发现国际上同类平台。省立医院为平台建设提供了强有力的服务器支持与平台基础设施,确保数据存储和计算分析的高效性,为平台的顺利运行提供了坚实的技术保障。

  通过提供高效的在线分析工具与便捷的数据下载服务,贬颁础平台极大地降低了数据访问与分析的门槛,为科研人员研究下丘脑在糖脂代谢调控、脑老化进程以及其他重要生理功能中的作用提供了强大的技术支持。该平台的构建不仅提升了数据利用率,也为跨物种比较研究和下丘脑相关疾病的机制探索开辟了新途径。

  贬颁础平台整合了人类、小鼠、猕猴和狨猴的下丘脑单细胞转录组数据,涵盖了截至目前在国际顶级期刊上发表的相关数据,借助单细胞搁狈础测序技术提供的高分辨率细胞级别分子信息,为研究丘脑细胞异质性、糖脂代谢、脑衰老及神经内分泌功能等领域的研究提供了可靠的数据基础。通过集中整合多物种下丘脑的单细胞转录组数据,贬颁础平台不仅显着降低了数据获取的难度,还提供了功能强大的在线分析工具,该平台支持细胞类型识别、功能基因分析及生物学机制研究,进一步推动了数据分析的简便性与精准性。贬颁础的可视化功能支持用户根据研究需求进行灵活地二次分析,尤其在下丘脑对糖脂代谢与脑衰老等领域的深入研究中具有不可或缺的价值。

  作为一个综合性的科研平台,贬颁础不仅促进了下丘脑领域的学术进步,也为神经生物学及相关学科的交叉研究提供了重要的资源。平台的上线为下丘脑相关基础与临床研究提供了强有力的数据支持,具有显着的科学与应用价值。

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  下丘脑作为调控机体内稳态的重要神经中枢,参与多种激素的合成与释放,承担调控基本生命功能的核心任务,包括饮水与摄食行为、能量代谢、液体和电解质平衡、体温调节、觉醒-睡眠周期的维持、对压力源的应激反应以及与交配、分娩和哺乳相关的生殖行为等且相关机制不明。近年来,单细胞测序技术的应用显着推动了下丘脑研究的进展,为解析其在糖脂代谢和脑老化中的功能机制提供了全新视角。然而,现有公开的单细胞测序数据尚未系统整合,这不仅增加了数据获取与分析的复杂性,同时由于分析过程对硬件和技术要求较高,也限制了相关研究的广泛开展。

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